Mahir Kaynak, 1934 yılında Gaziantep'te dünyaya geldi.
İlk ve orta öğrenimini Gaziantep'te aldı. 1948’de Kuleli Asker Lisesi’ne girdi.
1953’te Harp Okulu’nu istihkam sınıfı subayı olarak tamamladı. 1957’de askerlikten ayrıldı.
1961’de İstanbul Ünverstes İktisat Fakültesi’ni bitirdi. Aynı ünversitede asistanlık yapmaya başladı. 1965'te doktor, 1971'de doçent oldu.
O dönemlerde Milli İstihbarat Teşkilatı'na (MİT) katıldı. 1966 TDO (Türk Devrim Ocakları) Başkan Yardımcısı oldu.
MİT içerisinde önemli görevler yürüttü.
1989’da İktisat profesörü oldu. 1993 yılında Gazi Ünversitesi’nden emekliye ayrıldı.
1971 yılında 9 Mart darbe girişimini ortaya çıkardı. Cuntacılar tasfiye edilirken, Mahir Kaynak'ın da MİT mensubu olduğu ortaya çıktı. Kaynak, olaylar yatıştıktan sonra da uzun yıllar MİT'te çalıştı, daire başkanlığına kadar yükseldi. 1980 yılında MİT'ten emekli oldu.
2014 yılında kısmi felç geçiren Prof. Dr. Mahir Kaynak, kaldırıldığı askeri hastanede 14 Şubat 2015 tarihinde hayatını kaybetti.
Eserlerinden bazıları:
- Uluslararası Eksende Terör ve Türkiye/ Terör Nasıl Bitirilir ? Nevzat Yalçıntaş,Mahir Kaynak, Ahmet Almaz Nokta Kitap.
- Erdoğan Operasyonu
- Amerika 11 Eylül Afganistan Irak
- Başımıza Çuval Geçirenler
- Yeni Ortadoğu Haritası (Emin Gürses ile birlikte)
- Büyük Ortadoğu Projesi ve Türkiye Üzerine Stratejik Analizler
- Dünyayı Kimler Yönetiyor (Ömer Lütfi Mete ile birlikte)
- İstihbarat ve Terör Oyunları
- Maskeli Balo / Türkiye, ABD ve Diğerleri
- Para İmparatorluğu / Kontrol Kimin Elinde?
- Sil Baştan
- Sonuçlardan Sebepler
- Üç... İki... Bir (Ters Labirentlerde Final)
- Yel Üfürdü Su Götürdü (otobiyografik hatıralar)
- Derin Devlet (Ömer Lütfi Mete ile)
- Yeni Dünya Düzeni
- Mit ve Türkiye (Oğuzhan İhtiyar- Truva Yay.- Kısa Röportajı)
- Geleceğin Türkiye'si Yeni Osmanlılar (Emin Gürses - Cem Küçük Röportajı)
- Darbeli Demokrasi (Olaylar ve Çözümlemeler)